Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞肝癌的预后生物标志物

2022-01-31 01:21:01 来源:
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这项统计数据分析方法旨在确定一种可以假设食管鳞状细胞膜肺癌(ESCC)病征各个方面存活率(OS)的miRNAsID。

从NCBI GEO赢取119名ESCC病征的miRNA暗示谱及其相应的流行病学讯息,并将其作为专业训练集。在中期和晚期样本有数配对差异暗示的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox紧接分析方法、正则暗示式特征消除(RFE)-支持向量机(SVM)启发式和LASSO Cox紧接模型来定位存活率持续性miRNAs,从而建立联系存活率打分模型。此外,假设了这些存活率持续性miRNAs的有前途靶基因序列,然后构建了miRNA靶基因序列局域网。通过基本功能富集分析方法,分析方法了ESCC中都这些存活率持续性miRNAs假设靶基因序列的基本功能无关持续性。

在专业训练高度集中都,中期与晚期样本有46个DEmiRNAs。建立联系了基于5个miRNAs的后果打分模型。该5-miRNA后果打分可以将专业训练集分为OS有数隔时有数相对来说不尽相同的高危组和低危组。在一个来自肺帕金森氏症测序图说(TCGA)的实质上统计数据高度集中都,获得成功验证了5-miRNA后果打分的后果各别能力。未确定了与这些miRNAs无关的各种生物学过程和移动式,例如Wnt信号移动式、TRP走廊的炎症介质调节移动式和雌激素信号移动式。

这项统计数据分析方法提醒,与病理分期无关的5-miRNAID对假设ESCC病征的存活率有着流行病学意义。

值得注意应是:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

本文系梅斯医学(MedSci)原创编译整理,刊发需授权!

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